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9．B
【分析】生物多样性通常有三个层次的含义，即生物种类的多样性、基因（遗传）的多样性和生态系统的多样性。
【详解】A．生物种类的多样性是指一定区域内生物钟类（包括动物、植物、微生物）的丰富性，如我国有高等植物3万余种，是世界上裸子植物最多的国家，我国有脊椎动物6000多种，体现了生物种类的多样性，A错误。
B．遗传多样性又叫基因多样性，基因的多样性是指物种的种内个体或种群间的基因变化，不同物种之间基因组成差别很大，生物的性状是由基因决定的，生物的性状千差万别，表明组成生物的基因也成千上万，同种生物之间的基因也有差别，每个物种都是一个独特的基因库，基因的多样性决定了生物种类的多样性，因此生物种类的多样性实质上是基因的多样性，即遗传多样性。菊花品种多，最根本的原因是是遗传多样性，B正确。
C．生态系统的多样性是指生物群落及其生态过程的多样性，以及生态系统的环境差异、生态过程变化的多样性，即生物所生存的生态环境类型的多样性等，C错误。
D．环境多样性不属于生物多样性，只是生态系统多样性的一部分，D错误。
故选B。
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